Resumen

OBJETIVO GENERAL: Desarrollo de aplicaciones para la integración y análisis de datos genómicos, epigenómicos y transcriptómicos en el contexto del estudio de enfermedades neoplásicas malignas con la finalidad de facilitar la identificación, validación y optimización de potenciales biomarcadores con valor diagnóstico, pronóstico y/o predictivo. También se extenderá a otras patologías. OBJETIVOS ESPECIFICOS: a) Luego de varias herramientas desarrolladas se encontraron varios features necesarios que comparten todas las herramientas. Se desarrollará una plataforma general que incluya todos estos features y permita desarrollar distintos módulos encima de ella. b) Continuar con el desarrollo de Bioplat 4, herramienta para el descubrimiento, validación y optimización de Biomarcadores con valor pronóstico en cáncer. Durante el período 2017 se publicó la versión 2 de Bioplat (www.cancergenomics.net) y obtuvo el premio Sinpatec 2017 que permitió presentar el proyecto en Silicon Valley. En este nuevo período, se proyecta implementar nuevas características y realizar corrección de errores, sobre la base de nuevas ideas y del feedback que hemos tenido de los usuarios y de los asistentes a las reuniones en Silicon Valley. c) Desarrollar la versión 4 de multiomics. Multiomics es una plataforma para el análisis genómico, epigenómico y transcriptómico. Durante este período se pretende implementar una nueva versión que incluya procesos asincrónicos, importador de bases de datos públicas, manejo de datasets en la nube, paralelización de los cálculos, entre otros. El objetivo es publicarlo en un journal de prestigio. d) Establecer contacto con otros grupos de genómica y transcriptómica, para iniciar proyectos conjuntos. Por ejemplo, desarrollo de nuevas herramientas. e) Brindar soporte a GENOMIT que surgió como spin-off de este grupo de investigación.