Resumen

OBJETIVO GENERAL: Desarrollo de aplicaciones para la integración y análisis de datos genómicos, epigenómicos y transcriptómicos en el contexto del estudio de enfermedades neoplásicas malignas con la finalidad de facilitar la identificación, validación y optimización de potenciales biomarcadores con valor diagnóstico, pronóstico y/o predictivo. OBJETIVOS ESPECIFICOS: a) Continuar con el desarrollo de Bioplat, herramienta para el descubrimiento, validación y optimización de Biomarcadores con valor pronóstico en cáncer. Si bien la versión 1 ya está publicada, durante este año se proyecta implementar nuevas características ya planificadas en el “product backlog” del proyecto. Se propone diseñar e implementar también, un módulo independiente para la administración de los datos genómicos que subyacen la aplicación (genoma, gene signatures, sondas) denominado bioplat admin. Bioplat admin permitirá a los usuarios mantener versiones actualizadas de los datos genómicos (por ejemplo, el último release del genoma humano). b) Desarrollo de nuevas aplicaciones en el ámbito de la investigación básica en cáncer: • Bioplat cloud: Base de datos curada de gene signatures y experimentos de cáncer, extraídos de diferentes fuentes de datos o publicadas por usuarios finales para luego ser curadas. • Multiomics: Paquete R para el análisis genómico, epigenómicos y transcriptómico. c) Definir proceso de desarrollo y herramientas adecuadas para llevar adelante los proyectos descriptos en a y b. d) Establecer contacto con otros grupos de genómica y transcriptómica, para iniciar proyectos conjuntos. Por ejemplo, desarrollo de nuevas herramientas. e) Formar un spin-off a partir de la incubadora UAI, para ofrecer desarrollo de productos y servicios de análisis de datos biomédicos. Bioplat podría ser el punto de partida. f) Trabajar en colaboración con investigadores experimentales para poder comprobar la validez de algún marcador identificados mediante el empleo de las herramientas desarrolladas (BioPlat, Multiomics, etc.)